在某些情況下，蛋白質(zhì)染色的影響可能會干擾后續(xù)分析。例如，當需要酶活性時，考馬斯染色；或者當氨基酸的共價修飾會產(chǎn)生虛假結果時，在氨基酸分析之前進行銀染色。在這些情況下，通常使用“導向帶"。引導條是與待分析泳道平行的泳道，包含尺寸標記或重復樣品。凝膠運行后，將導帶剪下并染色，然后與凝膠重新對齊并用作模板來引導條帶切除。該技術很簡單。常見的錯誤是染色后未能用電泳緩沖液重新平衡凝膠。由于許多污漬會導致凝膠收縮或膨脹，重新平衡對于準確和一致的重新調(diào)整是必要的。

在引導帶技術中，平行泳道被切除并染色以引導帶切除。